奥塔哥大学的商学院是世界上为数不多的几个荣获欧洲质量发展体系(EQUIS)和美国国际商学院联合会(AACSB)双重认证的商学院之一。因此，学生在这里获得的学历能够得到全世界的认可，毕业后无论是选择就业还是继续求学都更有竞争力。此外，奥塔哥大学还是国际管理战略合作组织(PIM)的成员，这是一个云集了全世界最优秀商学院的组织。凭借这一身份，奥塔哥大学能够为商学院的学生提供大量的学生交流机会。(注：奥塔哥大学是新西兰唯一的PIM成员)

　　学院设有一系列本科和研究生课程，涉及会计学、经济学、创业学、金融与定量分析、国际商务、管理学、营销学和旅游等专业领域。奥塔哥大学的全日制MBA课程是新西兰在国际上最具影响力的MBA课程。奥塔哥在2014 QS(Quacquarelli Symonds)世界大学学科排名中跻身会计学和财务专业全球百强之列。

　　保健科学学院和健康科学部由医学院(包括医学科学学院)、牙医学院、药学院和物理理疗学院组成。除了上述领域的本科专业课程之外，健康科学部还设有一系列研究生培训和专业实践课程以及硕士和博士学位研究型课程。

　　健康科学部侧重于学术研究，科研水平在国际上受到广泛认可。它的研究优势很大程度上得益于生物化学、微生物学、人类营养学、生理学、解剖学、化学和药理学等各学科之间以及医学和牙科学等临床科系之间的紧密协同作用。这意味着奥塔哥大学的教师是一些掌握着各领域最新知识的学者和临床医生。奥塔哥在2014 QS(Quacquarelli Symonds)世界大学学科排名中跻身医学和药剂学以及药理学学科领域全球百强之列。

　　人文科学部下设多个专攻文科和社会科学领域的科系，开设有多个学科领域的课程，同时提供教育与教学、法学、社会服务和神学方面的专业课程。人文科学系所开展的研究可以用卓越和多样化两个词进行概况。2012年所开展的绩效科研基金(PBRF)评审最终将奥塔哥大学认定为新西兰艺术、社会科学和人文专业最好的院校之一。在2014 QS(Quacquarelli Symonds)世界大学学科排名中，奥塔哥的历史专业排名第30位，法律专业排名第37位，英语语言与文学专业排名第28位，而哲学、社会学、地理学和教育学专业则跻身全球百强之列。

　　理学部包括各种自然科学、物理学和应用科学专业。学校在应用科学与测量学、生物学与化学、计算机科学、地球与海洋科学、环境与生态学、食品科学与人类营养学、物理学与数学、体育、心理学以及科学传播领域均开设有本科和研究生课程。理学部的教学人员中很大一部分都在从事着世界级的科研工作。从这里毕业的学生前往美国和英国攻读研究生学位时总是能够获得国际奖学金，这给毕业生们带来了极大的成就感。在2014 QS(Quacquarelli Symonds)世界大学学科排名中，奥塔哥的心理学专业排名世界第19位，而生物科学专业则跻身全球百强之列。