制药工程专业与药学类专业相同点在于同属于生物医药领域。不同点在于所属学科门类不同，培养方向也有侧重。

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制药工程VS药学类(药物制剂、药学)前者强调应用，后者注重研发

制药工程专业，属于工科专业，毕业后授予工学学士学位。药学类专业属于医学专业，授医学学士学位，目前开设药物化学、药理学、药物分析及药物制剂四个专业方向，其中药物制剂方向也可授予工学学士学位。

以南京工业大学为例，制药工程专业以工程应用研究为主，专业学习主要围绕药物制造过程中的工艺技术、生产设备和药品质量控制等方面进行。依托学校教育部首批 卓越工程师 试点高校的平台，注重培养学生的工程实践能力，打造 卓越制药工程师 。大四学年，学生将进入大中型医药企业接受工程实践方面的训练。就业以后大多进入知名药企，从事医药企业的工程技术、生产管理和质量控制等领域工作。药学类专业偏重学生科研能力的培养，主要以新药开发为主。专业学习围绕新型药物设计制造、药物安全性评价、药物新剂型开发和药品质量控制方法等方面进行。依托江苏省药物研究所、江苏省中美转化医学研究院等学科平台，学生毕业后可胜任新药研发、药品质量检验及药品临床应用等领域的工作。

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