两个专业最大的区别是，生物技术的学生学习与生物相关的技术知识，而生物工程专业，偏重生物医药方向。

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生物技术VS生物工程前者研究基因，后者学制药

生物技术的学生学习与生物相关的技术知识，课程相对来说偏理论，毕业生拿理学学士学位，成为生物技术领域相关的科技人才。近一半优秀学生通过保送或考研(微博)进入国内著名大学和研究机构继续研究生学习，也会在高等学校、科研机构及医药、化工、食品、农林、牧渔、环保、园林等行业的企事业单位和管理部门，从事与生物技术相关的应用研究、技术开发和推广、生产管理、行政管理等工作。

生物工程专业，偏重生物医药方向，主要培养与生物制药领域相关的生物工程科技人才，前两年的基础课程和生物技术类似，但后两年专业课主要和药学相关，比如药事管理，生物制药等课程，所学知识应用性更强，毕业生拿工学学士学位，毕业生能够在生物医药、生物化工等行业的高新技术企业从事相关产品、工艺及装备的研究、开发、设计、管理及市场营销等工作，也可在商检、药检、药事、海关、工商、税务和政府管理部门从事相关的监督管理工作。

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