每年都有很多在国内研究生毕业或读研三的研究生申请人，当然由于自愿或不自愿的原因，自己的本科专业方向与研究生的专业方向不一致，如本科专业是自动化，研究生专业是计算机软件理论；再有本科专业是应用物理，研究生专业方向是电子材料，还有本科专业是信息管理与信息系统，研究生专业方向是教育技术等。还有跨专业读的研究生，甚至本科专业是机械工程，研究生专业方向是管理工程。

本科与研究生专业方向不同有优势也有弱势，优势就是你知识面比较宽，有交叉学科研究的背景基础，美国大学还是比较重视广泛研究背景知识的申请人的，弱势就是研究深度可能不够，知识的衔接性不够好。

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美国大学对学生的研究选择是自由的，美国教授认为你选择的研究方向就是你最喜欢的。你按你自己的硕士研究生专业方向申请美国大学的博士是合乎逻辑的。如果你喜欢你的研究生专业，研究生GPA和研究成果还不错，而且读硕期间有几门与研究方向相关的主要课程也都学过了，那当然要按研究生专业方向申请更有竞争力，毕竟中国研究生读三年也不是不短的学习和研究时间。你很好的研究生GPA和研究成果不用，反而申请本科的研究方向，美国大学教授可能认为你认知上有问题。

如果硕士研究生专业方向不是自己喜欢的，研究生GPA不高，也没有论文发表等研究成果，还是本科GPA比较高，想按本科专业方向申请，也是可以的，但你要在个人陈述中说明你为什么不喜欢自己的研究生专业方向，要有个合理的理由让美国教授信服，这样最好。

总之，按照自己的硕士研究方向申请符合逻辑和研究兴趣的一贯性，也算申请人的一个优势。返回去按照本科专业方向申请也是可以的，但不建议作为首选。两者申请美国大学博士需要读的时间可能相差不大。

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