美国生物工程专业包括五大工程，即遗传工程(基因工程)、细胞工程、微生物工程(发酵工程)、酶工程(生化工程)和生物反应器工程。在这五大领域中，前两者作用是将常规菌(或动植物细胞株)作为特定遗传物质受体，使它们获得外来基因，成为能表达超远缘性状的新物种——“工程菌”或“工程细胞株”。后三者的作用则是这一有巨大潜在价值的新物种创造良好的生长与繁殖条件，进行大规模的培养，以充分发挥其内在潜力，为人们提供巨大的经济效益和社会效益。 　　生物工程和生物技术都是生物学大学科的理论的应用型研究学科。生物工程狭义上偏向于工程，生物技术偏向于理论。具体来说生物技术包括基因工程、生物化学等上游技术，而生物工程包括微生物发酵及产物分离中下游技术。但是随着科学的发展，生物工程理论性越来越强，生物技术的应用性也愈来愈明显。两者的差异越来越小。生物工程也倾向于研究基因、代谢等上游知识，所以生物技术和生物工程难以区分，故而干脆将两者合二为一分析。 　　美国生物工程就业方向主要包括：微生物技术、生物制药、环境保护等。

　　(1) 微生物技术方向：研究主要以微生物为研究对象，研究微生物的生理生化、代谢调控及发酵过程控制与优化。由于研究的领域比较大(整个微生物体系)，而且微生物学几乎是生物工程的基础之一。这个专业就业前景比较广，可以从事生物制药、植物保护、环境保护等相关方向的研究和管理工作。

　　(2) 生物制药方向：生物药区别于化学合成药物，主要指微生物次级代谢物及动植物的提取物，生物活性大，毒副作用小，因此生物制药的前景比较好。研究的内容主要包括：微生物及海洋微生物药用代谢产物的研究;动植物天然产物的提取分离。 毕业生可以在制药行业从事研发生产及管理的工作。

　　(3) 环境保护：环境科学虽然是个综合学科，但生物工程是其重要的技术基础。主要是利用微生物技术来对工业有毒废气、废水的处理、生活污水处理及较大水体的治理(对河流、湖泊水华的治理)。毕业生既可以在国家环境保护部门从事管理和研究工作，也可以在污水处理厂及化工、制药相关企业工作。

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